مولوی عبیدالله، رئیس محکمه نظامی دولت طالبان در نشستی با ملایعقوب سرپرست وزارت دفاع و سراج‌الدین حقانی سرپرست وزارت داخله گفته است باید قبل از دیگران قانون را بالای خود تطبیق کنیم تا به مردم عدالت را نشان دهیم. آنان تصمیم گرفتند در اجرای احکام محکمه نظامی قاطعانه عمل شود.
پیش از این، ملایعقوب گفته بود شنیده است در نقاطی «افراد طالبان کسانی را به خاطر دشمنی کشته‌اند، در حالی که طالبان عفو عمومی اعلام کرده و این شامل همه مخالفان می‌شود.»
یعقوب خطاب به نیروهای خود گفته بود «هر گونه تهدید و قتل افراد، مخالف اهداف طالبان است و در صورتی که کسی با فرد دیگر منازعه شخصی داشته باشد، منازعه خود را باید از طریق محاکم امارت اسلامی حل و فصل کنند.»
سازمان‌های بین‌المللی و دیدبان حقوق بشر هم اعلام کرده‌اند طالبان،- نظامیان و کارمندان دولت پیشین را اعدام می‌کنند.
مقامات در وزارت امر به معرف و نهی از منکر طالبان اذعان کرده هرکسی در مخالفت با این گروه باشد، مجازات می‌شود.
برخی منابع می‌گویند طالبان دچار اختلافات درونی و چند دستگی هستند.
تاکنون هیچ گزارشی از مجازات افراد طالبان توسط محکمه‌های خود این گروه منتشر نشده است.