منابع از بازداشت سید باقر محسنی خبر داده‌اند. این استاد دانشگاه بارها از سیاست‌های طالبان انتقاد کرده.او در آخرین پیامش در فیسبوک نوشته که مناظره او با نعیم وردک سخنگوی طالبان در قطر، «به دلیل فشار گروه حاکم» از نشر باز ماند.محسنی از عصر روز جمعه ناپدید شده و تلفنش غیرفعال است.
محسنی در یادداشت دیگری با انتقاد شدید از بازرسی خانه به خانه نیروهای طالبان، این اقدام آنان را «غیرقانونی و غیرشرعی» خوانده و گفته است: «کاربرد زور و ایجاد ترس برای تحکیم پایه های حکومت، نتیجه چندانی نخواهد داشت. در عصر حاضر، حکومت بدون رضایت مردم تداوم چندانی نخواهد داشت».
او در مناظره‌های تلویزیونی خود با حضور افراد طالبان تاکید کرده است که انتقادات او از طالبان به معنای طرفداری از فساد در دولت پیشین نیست.
پیش از این نیز گروه طالبان فعالان رسانه‌ای و کارشناسان را بازداشت کرده که مورد انتقاد شدید جامعه جهانی قرار گرفته است. اوایل سال روان میلادی، فیض الله جلال، استاد دانشگاه در پی مناظره و بحث تلویزیونی دستگیر شد. با فشار جامعه جهانی، سازمان عفو بین‌الملل و انتقاد گسترده مردم جلال از بازداشت رها شد.