تروت از سال ۲۰۲۲ تا ۲۰۲۶، در مدت چهار سال هدایت «ببرهای آبی» را بر عهده داشت و در این مدت نقش مهمی در پیشرفت کریکت افغانستان ایفا کرد. اداره کریکت کشور در صفحههای رسمی خود با انتشار پستی، از این مربی خداحافظی کرده است.
به گفته کریکتبورد افغانستان، در دوران حضور جاناتان تروت، تیم ملی به دستاوردهای بزرگی دست یافت؛ از جمله پیروزیهای تاریخی در برابر تیمهای بزرگ جهان در رقابتهای جام جهانی، درخشش در سلسله بازیهای دوجانبه و ارتقای جایگاه کریکت افغانستان در سطح بینالمللی.
کریکتبورد این تغییر را بخشی از برنامه پیشرفت و تحول دانسته و در اعلامیه رسمی خود نوشته است، هیچ تیم بینالمللی برای همیشه زیر نظر یک مربی باقی نمیماند. این تغییر برای افغانستان آغاز فصل تازهای است، در حالی که کریکتبورد کشور در مسیر اهداف درازمدت توسعه خود گام برمیدارد.
میرویس اشرف، رئیس عمومی کریکتبورد افغانستان، نیز از تلاشها و زحمات تروت قدردانی کرده و گفته است، او نقش ارزندهای در رشد و پیشرفت کریکت افغانستان داشته و ما از همکاری صادقانهاش سپاسگزاریم.
از سوی دیگر، خود جاناتان تروت نیز در پیام خداحافظیاش گفته است، همکاری با تیم ملی افغانستان برای من مایه افتخار بود. عشق، شجاعت و تلاش بیپایان بازیکنان افغانستان برای پیروزی واقعاً ستودنی است.
هنوز جانشین او مشخص نشده است، اما کریکتبورد افغانستان اعلام کرده که نام سرمربی جدید پس از پایان جام جهانی بیستآوره اعلام خواهد شد.
در عین حال، اداره کریکت افغانستان همچنان از پایان همکاری با آندریو پوتیک، مربی توپزنی تیم ملی، خبر داده است. قرارداد او در ماه دسمبر ۲۰۲۵ به پایان میرسد. پوتیک از جنوری ۲۰۲۴ کار خود را با تیم ملی افغانستان آغاز کرده بود.