جنگجویان طالبان پس از ورود به شهر مزار شریف در هفدهم اسد ۱۳۷۷، دست به کشتار گسترده غیرنظامیان زدند. نهادهای حقوق بشری تایید کردند که این گروه با تصرف این شهر، مرتکب «کشتار هزاران غیرنظامی» شده است.
شورای عالی مقاومت ملی برای نجات افغانستان روز جمعه، نوشت که طالبان در حمله سهروزه خود به مزار شریف از هشت تا ۱۲ هزار غیرنظامی را به قتل رساندهاند. این شورا از این روز به عنوان «روز سیاه در تقویم عدالت و انسانیت» یاد کرده است.
در اعلامیه این شورا آمده است: «طی این جنایت بیرحمانه باشندگان بیدفاع شهر بهشمول زنان، کودکان و سالمندان بهگونه سیستماتیک قتلعام شدند. اجساد قربانیان در کوچهها، مساجد، مکاتب و شفاخانهها وحشیانه مثله شدند.»
شورای عالی مقاومت ملی برای نجات افغانستان همچنین تاکید کرده است که این کشتار «فاجعه انسانی و نسلکشی آشکار» بوده است.
شورای مقاومت ملی متشکل از جریانهای سیاسی مخالف طالبان است. این شورا از نهادهای بینالمللی، دادگاههای ذیصلاح جهانی خواسته است تا صدای بازماندگان قربانیان مزار شریف را بشنوند و اجازه ندهند جنایت، بار دیگر تکرار شود.
این شورا به حمله طالبان به قنسولگری ایران در مزار شریف و کشتار دیپلوماتهای ایرانی نیز اشاره کرده و این حمله را «تجاوز روشن به مصونیت دیپلوماتیک» خوانده است.
پیشتر وزارت خارجه جمهوری اسلامی نیز با صدور بیانیهای خواهان شناسایی عاملان حمله به قنسولگری ایران در مزار شریف و کشتار دیپلوماتهای ایرانی شد.